Harp okulunda okuduğu sırada Jön Türkler 'le ilişkisinden dolayı Sultan Abdulhamid Han tarafından Hicaz 'a sürgün edildi.

Burada zindandan kaçarak padişaha karşı ayaklanma başlattı. Meşrutiyet'in ilan edilmesiyle başlattığı isyanı sonlandırdı. Daha sonra arkadaşlarıyla birlikte kurduğu Teşkilat-ı Mahsusa isimli istihbarat örgütüne katıldı.

1911 yılında Trablusgarp 'a giderek Enver Paşa ile beraber direnişte yer aldı. 1912 yılında yaşanan 2. Balkan Savaşı'nda Çorlu, Tekirdağ, Malkara, Hayrabolu ve Edirne'nin kurtarılmasında büyük rol oynadı.

Birlikleriyle Batı Trakya'yı da ele geçirerek, burada Batı Trakya İslam Cumhuriyeti'ni kurdu. 1. Dünya Savaşı'nın başlamasının ardından Teşkilat-ı Mahsusa'nın Arap Yarımadası'ndan sorumlu başkanı olarak göreve başladı. İngilizlere karşı başlatılan Kanal Harekatı'nda savaştı. 1918 yılında Hayber'de Faysal'ın 20 bin kişilik birliğine karşı 40 kişilik grubuyla beş saatten fazla çarpıştıktan sonra yaralı olarak esir düştü.

Eşref Sencer Kuşcubaşı Daha sonra birliğiyle birlikte Malta'ya sürgün edildi. İngilizlerle imzalanan esir değiş-tokuş anlaşmasında serbest bırakıldı. Kısa bir süre sonra da Anadolu'ya geçerek Milli Mücadele'ye katıldı. Müthiş yaşam öyküsüne sahip Kuşçubaşı Eşref Bey, 1964 yılında Aydın ’ın Söke ilçesinde bulunan çiftliğinde vefat etti ve Eşref Sencer Kuşcubaşı Söke Granta Aile Kabristanlığı’nda toprağa verildi.